1、登记注册的依据不同

注册商标是依照商标法规定进行注册，具有唯一性。而企业名称依照公司法，在我国依照企业登记方面的法律，经工商行政管理机关登记注册之后，可以受到一定的保护。

但这种保护只限于企业名称本身，保护不到企业的产品，企业的产品遭到仿冒侵权，一般很难从企业名称登记的法律中获得保护。

2、专用权范围不同

企业名称不是区别不同企业的商品或劳务的标记，它区别的是产品的不同生产者和经营者.所以，法律上并不要求企业名称具有商标那样的显着性，在相距很远的地方，两个企业使用相同或近似的名称.实际上不会导致公众的误认，因而是允许的。

而对于商标，如果两个生产同类产品的企业，使用相同或近似的商标，在市场上就会造成产品来源的混淆，进而导致消费者在产品选择上的误认，因而应予以避免。

3、取得方式不同

在我国，对商标实行自愿注册与强制注册相结合的原则，其做法是除按规定某些特定商品必须使用注册商标以外，一般商品的商标采取自愿注册原则，即注册的享有专用权，未注册的仍可使用，但不享有专用权；而对企业名称，未经核准登记的名称不准使用，也就不享有名称权。

4、权利特征和内容不同

商标权是工业产权，只具有财产权的特征，不带有人身性，而企业名称权是一种兼有人身权和财产权特征的权利。所以，企业名称权一般不允许单独转让或者许可他人使用。